先读语言学校然后申请研究生或者考修士：这个过程比较长，我个人不是很了解，所以不多说。但是如果日语有N1水平了，建议就不要读语言学校了，因为比较浪费时间。不过有的大学的个别专业，不接受研究生申请，如果想去读修士只能直接参加修士考试通过才行（比如东京大学经济学大学院），这种情况下可以考虑先读语校。
直接到日本考修士：在国内做准备然后办个考试签证飞过去参加考试。确实有人成功了，但是总体上来说，难度很大。特别是顶尖院校，一般都是研究生考上修士的概率很大，从国内飞过去直接考试成功率较低。不过有的大学的个别专业，不接受研究生申请，如果想去读修士只能直接参加修士考试通过才行（比如东京大学经济学大学院），这种情况下可以考虑直接过去考。
在国内申请研究生，以后再接着考修士：这个是是大多数学生申请日本留学时选择的途径，所以在此多说一些。
在此之前先要了解两种招生制度：内诺制和事前审查制。
内诺制是指学校的教授同意你作为研究生入学就OK了，也就是教授有着录取权。事前审查制是指教授没有录取权，如果想申请，就要在“募集要项”规定的时间内向学校提交规定的文件，由院系教授组成的审议会进行考核，审议会同意了才可以，而且有时会根据你的情况给你安排其他教授作为导师而不是你志愿的教授。
那么，哪些学校是内诺制，哪些学校是事前审查制呢？这需要同学到相应大学的研究科网站去查，因为每所大学、每个研究科的情况可能都不同。比如东京大学的文科专业基本上都是事前审查制（经济学需要直接考修士，上文已经提到），名古屋大学文科专业有一部分是内诺制有一部分是事前审查制。多说一句，帝国类大学的传媒学专业基本上都是事前审查制。
当然这里还有一个例外，那就是京都大学。
由于以前出现了很多中国学生申请文书造假的情况，京都大学成立了AAO办公室。中国大陆的学生如果想申请京都大学，必须先和AAO办公室进行联系，提交必要的材料和表格（用电子邮件提交电子版，志愿的教授等等信息都要提交）。AAO办公室会审查材料的真伪并且评定学生的水平，如果学生的材料造假或者水平不足就予以拒绝。如果AAO认定材料没有问题并且水平足够，则会将材料提交给你想申请的教授，问教授的意愿。如果教授看了文书后同意和你进行沟通，则AAO办公室会回复给你说通过已经通过审核可以和教授直接联系。教授可能会提一些问题，要认真回答，还可能会安排SKYPE面试，这些都通过了，就成功申请京都大学的大学院研究生了。需要注意的是，原则上AAO只接受申请一位教授，如果这位教授不接收，那么就会被拒绝，不能再继续申请京都大学。说起来是个有些残酷的制度。
这些制度都介绍完了，继续谈一下如何申请。
针对内诺制，要将上文“关于帝国类大学的申请”中提到的条件一一具备齐全，在学校教务处开好英文版在读证明和成绩单（并且扫描为电子版），将N1成绩单和TOFEL iBT成绩单扫描为电子版，写一封自我介绍（除了基本信息外，还要写一下自己取得的荣誉、大学课程概况、自己对学科的认识、对日本的认识、留学的准备等等），连同研究计划书发给教授。一般在入学日期的前7个月-8个月即可，如果是顶尖大学，入学日期的前10个月就可以联系教授。措辞一定要礼貌客气谦逊。发完邮件后，不要着急。因为日本的教授都很忙，可能要过两三周才回信，等一个月才收到回信也不是不可能。如果教授回绝，也要礼貌致谢。如果教授对你感兴趣，提出了一些问题，一定要礼貌客气诚实地回答，不会的问题不要装懂。随着和教授的交流深入，教授可能会要求进行SKYPE面试。如果出现这种情况，不要慌张，客气地答应下来，而且时间安排尽量依教授决定。
SKYPE面试的时候，礼貌谦逊诚实自不用说，还有就是要有一种谦卑的姿态，对于教授的问题，要思考一小下（用“えーと”、“そうですね”之类的），然后针对问题作答，不多说，不过分表现自己的知识，不会的问题不要装会，可以用“あのう、すみませんが、この問題についてあまりわかりませんけど。面接の後で調べて、先生にメールしてもよろしいでしょうか”回答，教授不会为难。不过，SKYPE面试的时候问什么真的很难说，完全要看教授意愿。有的教授比较侧重学生的生活，问问大学时代最感兴趣的哪门课，有什么兴趣爱好，将来想做什么等等。有的教授会比较侧重学术，问一些专业领域内的问题，特别是针对研究计划书提问。总之灵活度很大。从准备层面来看，①练习自我介绍；②仔细阅读研究计划书并且深入思考，模拟教授会提到的问题并准备其回答内容；③针对“为什么要来日本留学”、“为什么想进入我的研究室”、“大学期间有什么兴趣爱好”等等可能提出的问题进行思考，并模拟回答内容。如果SKYPE面试成功，就意味着教授接收你做研究生了。
针对事前审查制，要仔细阅读院系的募集要项然后整理制作各种规定的材料，在规定的时间内提交，之后等消息就好。不过建议在提交材料的一个多月之前和想申请的教授联系一下，说明一下自己的情况等等，让教授有个印象。
针对京都大学申请，请按照要求准备好各种材料，联系AAO即可。
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